Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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SNX13Q9Y5W8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX13Q9Y5W8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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