Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THRAP3Q9Y2W1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THRAP3Q9Y2W1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms