Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM2AQ9Y2K7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms