Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPS5Q9UPZ3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HPS5Q9UPZ3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms