Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD4AQ9UPU9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms