Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC12A4Q9UP95 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC12A4Q9UP95 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms