Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms