Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALKQ9UM73 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms