Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMCC3Q9ULS5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms