Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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