Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SALL4Q9UJQ4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms