Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms