Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CNOT7Q9UIV1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNOT7Q9UIV1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms