Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VTI1BQ9UEU0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VTI1BQ9UEU0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms