Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DBF4Q9UBU7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DBF4Q9UBU7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms