Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CKLFQ9UBR5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms