Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms