Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCKIPSDQ9NZQ3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCKIPSDQ9NZQ3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCKIPSDQ9NZQ3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCKIPSDQ9NZQ3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms