Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NKIRAS1Q9NYS0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NKIRAS1Q9NYS0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms