Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NLE1Q9NVX2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms