Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMPRSS4Q9NRS4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMPRSS4Q9NRS4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms