Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCCC2Q9HCC0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms