Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BCAS3Q9H6U6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms