Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GFRA4Q9GZZ7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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