Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTDSP1Q9GZU7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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