Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDGFDQ9GZP0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms