Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIM4Q9C037 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM4Q9C037 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms