Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCGF6Q9BYE7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCGF6Q9BYE7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms