Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SRRTQ9BXP5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms