Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRXQ9BXM0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms