Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYCP2Q9BX26 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYCP2Q9BX26 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms