Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNS3Q9BQ31 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNS3Q9BQ31 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms