Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOL4Q9BPW4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms