Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CMTM3Q96MX0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms