Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC43Q96MW1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms