Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPNS2Q96L46 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAPNS2Q96L46 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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