Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms