Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIRT1Q96EB6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIRT1Q96EB6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms