Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUNDC1Q96C34 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUNDC1Q96C34 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms