Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC59Q96AG4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC59Q96AG4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms