Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms