Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX54Q8TDD1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms