Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNDC9Q8TBE3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms