Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HJURPQ8NCD3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HJURPQ8NCD3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms