Protein–RNA interactions for Protein: Q86VZ4

LRP11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11Q86VZ4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP11Q86VZ4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms