Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SETXQ7Z333 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SETXQ7Z333 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SETXQ7Z333 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms