Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms