Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GDPD3Q7L5L3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms