Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms