Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL35Q6PF15 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms